Holger Gerdes ist Senior Fellow am Ecologic Institut und koordiniert den Bereich Bioökonomie. Der Schwerpunkt seiner Arbeit liegt auf der Erforschung und Umsetzung partizipativer Instrumente für ein nachhaltiges Management natürlicher Ressourcen im Rahmen der entstehenden Bioökonomie. Daneben beschäftigt er sich mit der ökonomischen Bewertung von Biodiversität und Ökosystemleistungen und der Integration solcher Bewertungen in politische Strategien. Er arbeitet in Deutsch und Englisch und besitzt gute Sprachkenntnisse des Französischen und Niederländischen.

Aktuell leitet Holger Gerdes das Projekt Konzepte, Instrumente und Anwendungen für eine gemeinschaftliche Entwicklung der Bioökonomie in ländlichen Gebieten Europas (SCALE-UP). Zuvor leitete er die Projekte Regionale Bioökonomie-Strategien für eine gestärkte ländliche Entwicklung in der EU (BE-Rural) und Innovative Konzepte für eine partizipative Gestaltung der europäischen Bioökonomie (BioSTEP). Zudem koordiniert er den Beitrag des Ecologic Instituts zum langfristig angelegten Forschungsprojekt Nachhaltiges Management des Unterbodens als Teil der Bioökonomie (Soil³).

Neben seinen Aktivitäten in nationalen und europäischen Forschungsprojekten bearbeitet Holger Gerdes Projekte für eine Vielzahl öffentlicher Auftraggeber, einschließlich der Generaldirektion Umwelt der Europäischen Kommission, der Generaldirektion Forschung & Innovation der Europäischen Kommission, der Europäischen Umweltagentur (EEA), des Europäischen Ausschusses der Regionen (AdR) und des Umweltbundesamts (UBA) in Deutschland.

Holger Gerdes unterstützt die Europäische Exekutivagentur für die Forschung (REA) sowie die Flämische Forschungsgemeinschaft (FWO) bei der Evaluierung von Projektanträgen und hat als externer Gutachter zur Evaluierung von vier Master-Studiengängen im Cluster ‚Umwelt‘ der Universität Hohenheim beigetragen. Seit 2010 unterstützt Holger Gerdes das Zürich-Basel Plant Science Center (PSC) bei der Organisation eines Graduiertenkurses zu evidenzbasierter Politikgestaltung, in dessen Rahmen er umweltökonomischen Fallstudien entwickelt und betreut.